episode1

: Lorsqu'un bâtiment s'effondre, House dispose de peu de temps : il doit diagnostiquer Meagan, une jeune femme qui a survécu au désastre. À cause de ses blessures, elle ne peut communiquer qu'en clignant des yeux. House, sans équipe depuis que Foreman et Cameron ont démissionné et qu'il a renvoyé Chase, fait part de ses réflexions à un agent d'entretien de l'hôpital, il a besoin de quelqu'un, qui que ce soit, sur qui éprouver ses théories. Obstiné à vouloir établir seul un diagnostic, House finit par se rendre compte que le cas n'est pas ce qu'il semblait être et que la solitude ne lui apporte pas de réponse.

episode2

House est sollicité par une pilote prénommée Greta, candidate au programme d'entraînement pour astronautes de la NASA. Greta souffre de troubles neurologiques qui font qu'elle transforme des images visuelles en sons ou entend avec ses yeux. Sachant que si la NASA était au courant de son problème elle rejetterait sa candidature, Greta supplie House de la traiter en secret. Dans le même temps, House est étonné d'apercevoir Cameron, Chase et Foreman en différents lieux de l'hôpital. 

episode3

Les dix derniers postulants désireux de faire partie de l'équipe de House se livrent une bataille féroce. House décide de les diviser en deux équipes : hommes contre femmes. Ils ont pour tâche d'établir le diagnostic et de traiter un homme en fauteuil roulant atteint d'atrophie musculaire spinale. Au fur et à mesure que les deux équipes s'affrontent, des complications surviennent. Pendant ce temps, Foreman dirige sa propre équipe dans un autre hôpital et recourt à un traitement « housien » pour venir en aide à un patient 

episode4

Alors qu'elle est prise de convulsions, une thanatopraticienne est victime d'hallucinations : elle se voit sauvagement violée par un des cadavres sur lequel elle travaille. Plus tard, à l'hôpital, elle se comporte comme si sa mère défunte était dans la pièce avec elle. De son côté, Cameron donne des conseils à un des sept candidats pour rejoindre l'équipe de House ; Foreman déjeune avec Cuddy. 

episode5

Foreman fait son grand retour à l'hôpital et a pour tâche de superviser les candidats de House. Un homme est agressé et est victime d'un arrêt respiratoire. Il ne se souvient pas de son identité mais peut « lire » les personnalités : il repère la personnalité la plus dominante dans une pièce et endosse ses traits pour se créer une identité temporaire. La précision avec laquelle il est capable d'évaluer une personnalité intrigue House : celui-ci le manipule pour qu'il examine son entourage et puisse déterminer qui de House ou de Cuddy est le plus dominant. 

episode6

House est recruté par la CIA pour aider à poser un diagnostic chez un agent atteint d'un mal inconnu. Le cas médical de celui-ci est dirigé par le Dr. Samira Terzi qui ne délivre que peu d'informations quant aux antécédents de l'agent ou aux missions qu'il a remplies dans le passé. En possession d'informations limitées, House utilise des méthodes peu orthodoxes pour tenter de déchiffrer le code et établir un diagnostic dans les temps pour sauver la vie de son mystérieux patient. De son côté, Foreman fait face à la résistance des 6 candidats restant qui remettent son avis en cause et discutent le diagnostic d'une femme pilote de dragster qui a perdu connaissance après une course. 

episode7

House et son groupe sont suivis par une équipe de film documentaire alors qu'ils traitent un adolescent présentant une importante malformation faciale qui a eu une attaque cardiaque avant une procédure reconstructrice. Pendant que l'équipe s'attelle à trouver la cause du mal du jeune garçon, House est quelque peu décontenancé par une candidate en compétition pour une place au sein de son équipe et cette situation le pousse à remettre en cause les motifs d'admission qui l'ont incité à les choisir. 

episode8

House soigne un magicien dont le cœur à lâché alors qu'il tentait de s'évader, pieds et poings enchaînés, d'un bassin rempli d'eau. Pendant que les postulants restant en lice planchent sur un diagnostic pour l'illusionniste, House est fermement décidé à prouver que ce dernier n'est qu'un escroc feignant sa maladie pour dissimuler le fait qu'il a failli se noyer lors de sa représentation. Dans le même temps, House teste son équipe divisée en deux groupes : il leur lance un défi (impliquant Cuddy) et assurant au vainqueur l'immunité ainsi que la possibilité de proposer deux autres candidats à l'élimination. 

episode9

House propose un cas particulièrement difficile, mais motivant, aux candidats. Il s'agit d'un guitariste punk peu coopératif qui présente des antécédents d'usage de stupéfiants et de désobéissance civile. Cuddy ordonne à House de prendre une décision définitive quant à la composition de sa nouvelle équipe. House promet un poste dans son équipe à celui ou à celle qui donnera le diagnostic exact du patient. De son côté, Wilson informe un de ses anciens patients qu'il pensait être atteint d'un cancer au stade terminal qu'il s'est trompé dans son diagnostic. 

episode10

House et son équipe traitent le cas étrange d'une femme : celle-ci observait sa fille gravir un mur d'escalade lorsqu'elle a été prise d'une paralysie des mains. House mène son enquête sur la mère afin de trouver des pistes pour la guérir. Il est convaincu qu'elle garde certaines informations secrètes...

episode11

Lorsque Cate Milton (psychiatre bloquée au pôle Sud et seule médecin de sa station de recherche) tombe malade en pleine mission, elle et House sont lancés dans une relation longue distance spéciale. Dans l'impossibilité de l'évacuer ou de lui fournir du matériel médical supplémentaire, House et son équipe n'ont d'autre choix que de la traiter par webcam. Ils lui font faire toute une série de tests improvisés et douloureux qu'elle doit effectuer elle-même. Cate repousse toutes les recommandations de House. Elle n'est pas disposée à se servir du matériel médical et des médicaments de la station avant que House ne puisse lui apporter des preuves valides pour ses diagnostics. Lui et son équipe observent, impuissants, sa dégradation physique. Le comportement habituellement froid de House s'adoucit étrangement au fur et à mesure où il cherche des solutions pour la sauver. Dans le même temps, House mène sa petite enquête sur Wilson et est surpris de lui découvrir une liaison. 

episode12

House et son équipe soignent une femme admise au Princeton-Plainsboro suite à un malaise survenu à son mariage. Lorsqu'il découvre qu'elle a été productrice de musique, menant une vie débridée avant de se convertir au judaïsme hassidique, House affirme que les gens ne changent pas si facilement. Il pense que la décision apparemment irréfléchie de cette femme de changer de vie pourrait avoir un lien avec une maladie sous-jacente. L'équipe doit passer par de nombreux diagnostics, sans aller à l'encontre des croyances religieuses de la patiente, avant qu'il ne soit trop tard. Dans le même temps, House est préoccupé : Wilson entretient depuis peu une relation avec une femme dont la personnalité est proche de celle de House. 

episode13

House et son équipe traitent un patient se trouvant dans un état d'euphorie légère. House refuse de croire que la bonhomie de cet homme soit un sentiment naturel. Après avoir envisagé la présence d'une neurosyphilis, l'équipe soupçonne House d'être lui-même atteint d'une syphilis, ce qui expliquerait son comportement imbuvable. Dans le même temps, House et Amber cherchent à partager la garde de Wilson. House se sent de plus en plus délaissé par son vieil ami.

episode14

En regardant son soap opéra favori, House est certain que l'acteur principal est atteint d'une grave maladie, même si rien ne semble l'indiquer. Il kidnappe l'acteur de "Passion sur ordannance" , son feuilleton, pour l'hospitaliser contre sa volonté... Cela pourrait causer des problèmes à l'hopitâl , qui est au même moment inspecté. Pendant ce temps, Amber et Wilson, se disputent pour la première fois. 

episode15

Dans la première partie du Season Finale de House, House se retrouve dans une boîte de strip-tease, à boire seul. Souffrant d'une commotion cérébrale et d'une amnésie rétrograde partielle, il réalise qu'il a été victime d'un accident de bus. De fil en aiguille, House se souvient d'un patient mourant qu'il tenait à aider dans le bus. Il tente, par tous les moyens, de recouvrer la mémoire. La réponse à la question que House se pose obstinément pourrait engager plus d'une vie dans un diagnostic pour le moins pessimiste... 

episode16

House a découvert le nom du patient mystère : ce n'est autre qu'Amber, nouvelle petite amie de Wilson et ancienne postulante à l'équipe de House. Ce dernier tente de recouvrer la mémoire. Il veut faire resurgir des détails qui pourraient l'aider à sauver Amber. Cependant, la vérité, avec tout ce qu'elle implique, pourrait faire basculer à jamais les vies de House et Wilson...